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今から数十年後、古都上海から目と鼻の先の場所で、優秀なナノテクノロジスト、ジョン・パーシヴァル・ハックワースが、彼の属する強力な部族——ネオ・ヴィクトリアン——の厳格なモラル・コードを破った。彼は『若き淑女のための絵入り入門書』と呼ばれる最新型インタラクティブ・デバイスを違法にコピーしたのである。この入門書は、風変わりな公爵が孫娘のために依頼したものだったが、ハックワースはそれを自分の娘のために盗み出した。その目的は、自ら考えることのできる少女を教育し育て上げることにある。そしてその性能は極めて優秀だ。皮肉にも、ハックワースの密輸コピーは、間違った者の手に渡ってしまう。幼いネルとその兄ハーヴは「テート」——貧しく部族を持たない階級の者たちだ。ハーヴとその仲間がハックワースを襲ったとき、ハーヴはネルに特別なものを持ち帰る——その入門書を。犯罪が発覚した後、ハックワース自身もまた、錬金術師と呼ばれる謎の人物を探す旅に出る。彼の探求とネルの旅は、やがて入門書に運命を絡められたもう一人の探求者——広大で破壊的な情報ネットワークの鍵を握る女性へと導かれる。そのネットワークは、やがて人類の未来を解読し、再プログラムする運命にある。